基于宏基因组学的江西桃红岭梅花鹿潜在病原初步调查

近些年,江西桃红岭梅花鹿国家级自然保护区植被正向演替明显,大量梅花鹿(<italic>Cervus nippon</italic>)开始向保护区外围扩散和聚集,调查桃红岭梅花鹿潜在病原携带情况,有利于掌握其种群健康状况,进而制定精确的保护管理对策,因此在该保护区不同区域(核心区、缓冲区和实验区)采集梅花鹿新鲜粪便样品,并基于宏基因组测序技术分析其病原携带情况。结果表明:桃红岭梅花鹿携带病原微生物包括细菌、真菌、放线菌、支原体、衣原体和螺旋体,共34属63种,其中包含大量人兽共患病病原;病原丰度最高的5个属分别是拟梭菌属(<italic>Clostridioi...

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Main Authors: 陈璐瑶, 黄晓凤, 张壹萱, 詹建文, 刘武华, 刘小洪, 张阳
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife 2024-08-01
Series:野生动物学报
Subjects:
Online Access:http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails#10.12375/ysdwxb.20240306
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Description
Summary:近些年,江西桃红岭梅花鹿国家级自然保护区植被正向演替明显,大量梅花鹿(<italic>Cervus nippon</italic>)开始向保护区外围扩散和聚集,调查桃红岭梅花鹿潜在病原携带情况,有利于掌握其种群健康状况,进而制定精确的保护管理对策,因此在该保护区不同区域(核心区、缓冲区和实验区)采集梅花鹿新鲜粪便样品,并基于宏基因组测序技术分析其病原携带情况。结果表明:桃红岭梅花鹿携带病原微生物包括细菌、真菌、放线菌、支原体、衣原体和螺旋体,共34属63种,其中包含大量人兽共患病病原;病原丰度最高的5个属分别是拟梭菌属(<italic>Clostridioides</italic>)、李斯特菌属(<italic>Listeria</italic>)、克雷伯氏菌属(<italic>Klebsiella</italic>)、志贺氏菌属(<italic>Shigella</italic>)和沙门氏菌属(<italic>Salmonella</italic>),丰度最高的 5个种分别是艰难拟梭菌(<italic>Clostridioides difficile</italic>)、单核增生李斯特氏菌(<italic>Listeria monocytogenes</italic>)、肺炎克雷伯氏菌(<italic>Klebsiella pneumoniae</italic>)、肠炎沙门氏菌(<italic>Salmonella enteritidis</italic>)和福氏志贺氏菌(<italic>Shigella flexneri</italic>);不同研究区域中,核心区梅花鹿携带病原数量显著低于缓冲区和实验区。以上结果表明,桃红岭梅花鹿携带有多种病原,存在一定疫病发生风险。建议在保护区核心区积极开展栖息地矮化工作,同时开展高危病原的持续性监测及预警,并加强对保护区外围扩散梅花鹿种群的保护管理。
ISSN:2310-1490