北京雨燕心脏、肺脏、肌肉和血液转录组比较分析
为进一步丰富北京雨燕(<italic>Apus apus pekinensis</italic>)基因组数据,采用Illumina NovaSeq 6000测序平台对其肌肉、肺脏、心脏及血液转录组进行测序。结果显示:经质控后得到32.80 Gb的clean data数据,通过Trinity组装后,运用生物信息学方法与相关数据库比对,得到15 295个(71.3%)有功能注释的unigenes。使用StringTie软件对mapped reads进行拼接后与参考基因组比对,共发掘6 700个新基因。共13 869条unigenes在GO数据库中获得注释,分类到3大类45个...
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| Main Authors: | 马春湘, 张昌盛, 刘燕, 田恒玖, 洪锦旋, 董玉兰 |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | zho |
| Published: |
Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife
2025-02-01
|
| Series: | 野生动物学报 |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails#10.12375/ysdwxb.20250116 |
| Tags: |
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