基于生物信息学途径评估 UBE2 家族及 UBE2T 基因在肺腺癌中的表达及临床意义
【目的】探究泛素结合酶E2家族和泛素结合酶E2T（UBE2T）在肺腺癌中的表达情况及其与临床病理特征之间的关系。【方法】利用linkedomics平台进行UBE2C、UBE2M、UBE2S、UBE2T、UBE2V2 mRNA表达水平与肺腺癌临床特征之间的关系分析，对总生存时间（OS）（Cox回归检验）、总分期（Kruskal-WallisH检验）、T分期（Kruskal-WallisH检验）、N分期（Kruskal-WallisH检验）及M分期（Wilcox秩和检验）进行差异比较。运用肿瘤基因组图谱（TCGA）数据库获取UBE2T基因在肺腺癌组织和癌旁组织中的表达信息，将结果进行两独立样本t检...
Saved in:
| Main Authors: | , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | zho |
| Published: |
Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University
2020-01-01
|
| Series: | Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/43567561/ |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| _version_ | 1841534871786225664 |
|---|---|
| author | 杨豪帅 赖慧娜 饶怡茹 林晓平 |
| author_facet | 杨豪帅 赖慧娜 饶怡茹 林晓平 |
| author_sort | 杨豪帅 |
| collection | DOAJ |
| description | 【目的】探究泛素结合酶E2家族和泛素结合酶E2T（UBE2T）在肺腺癌中的表达情况及其与临床病理特征之间的关系。【方法】利用linkedomics平台进行UBE2C、UBE2M、UBE2S、UBE2T、UBE2V2 mRNA表达水平与肺腺癌临床特征之间的关系分析，对总生存时间（OS）（Cox回归检验）、总分期（Kruskal-WallisH检验）、T分期（Kruskal-WallisH检验）、N分期（Kruskal-WallisH检验）及M分期（Wilcox秩和检验）进行差异比较。运用肿瘤基因组图谱（TCGA）数据库获取UBE2T基因在肺腺癌组织和癌旁组织中的表达信息，将结果进行两独立样本t检验。利用GSEA软件进行KEGG通路及富集分析。【结果】UBE2C、UBE2M、UBE2S、UBE2T、UBE2V2 mRNA表达量与肺腺癌的临床病理特征存在相关关系。其中，UBE2T高表达者其OS较短，TNM分期较晚者UBE2T呈高表达，差异均具有统计学意义（P<0.05）。UBE2T mRNA表达量在肺腺癌中明显升高（P<0.01）。基因富集结果显示高表达的UBE2T与细胞周期（FDR=0），剪接体（FDR=0），DNA修复（FDR=0）及糖代谢等36个信号通路密切相关（FDR<0.05）。UBE2家族的UBE2C、UBE2M、UBE2S、UBE2T、UBE2V2 mRNA均与肺腺癌的临床病理特征存在相关关系，其中UBE2T的表达水平与临床分期及预后的关系最为密切，且与肿瘤细胞糖酵解通路密切相关。【结论】UBE2家族与肺腺癌临床病理特征相关。UBE2T mRNA有望成为肺腺癌新的生物标志物。 |
| format | Article |
| id | doaj-art-5c448ea096b44453b7eb541422ff6771 |
| institution | Kabale University |
| issn | 1672-3554 |
| language | zho |
| publishDate | 2020-01-01 |
| publisher | Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University |
| record_format | Article |
| series | Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban |
| spelling | doaj-art-5c448ea096b44453b7eb541422ff67712025-01-15T02:36:23ZzhoEditorial Office of Journal of Sun Yat-sen UniversityZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban1672-35542020-01-014143567561基于生物信息学途径评估 UBE2 家族及 UBE2T 基因在肺腺癌中的表达及临床意义杨豪帅赖慧娜饶怡茹林晓平【目的】探究泛素结合酶E2家族和泛素结合酶E2T（UBE2T）在肺腺癌中的表达情况及其与临床病理特征之间的关系。【方法】利用linkedomics平台进行UBE2C、UBE2M、UBE2S、UBE2T、UBE2V2 mRNA表达水平与肺腺癌临床特征之间的关系分析，对总生存时间（OS）（Cox回归检验）、总分期（Kruskal-WallisH检验）、T分期（Kruskal-WallisH检验）、N分期（Kruskal-WallisH检验）及M分期（Wilcox秩和检验）进行差异比较。运用肿瘤基因组图谱（TCGA）数据库获取UBE2T基因在肺腺癌组织和癌旁组织中的表达信息，将结果进行两独立样本t检验。利用GSEA软件进行KEGG通路及富集分析。【结果】UBE2C、UBE2M、UBE2S、UBE2T、UBE2V2 mRNA表达量与肺腺癌的临床病理特征存在相关关系。其中，UBE2T高表达者其OS较短，TNM分期较晚者UBE2T呈高表达，差异均具有统计学意义（P<0.05）。UBE2T mRNA表达量在肺腺癌中明显升高（P<0.01）。基因富集结果显示高表达的UBE2T与细胞周期（FDR=0），剪接体（FDR=0），DNA修复（FDR=0）及糖代谢等36个信号通路密切相关（FDR<0.05）。UBE2家族的UBE2C、UBE2M、UBE2S、UBE2T、UBE2V2 mRNA均与肺腺癌的临床病理特征存在相关关系，其中UBE2T的表达水平与临床分期及预后的关系最为密切，且与肿瘤细胞糖酵解通路密切相关。【结论】UBE2家族与肺腺癌临床病理特征相关。UBE2T mRNA有望成为肺腺癌新的生物标志物。http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/43567561/UBE2TUBE2 家族基因表达数据库泛素化糖代谢 |
| spellingShingle | 杨豪帅 赖慧娜 饶怡茹 林晓平 基于生物信息学途径评估 UBE2 家族及 UBE2T 基因在肺腺癌中的表达及临床意义 Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban UBE2T UBE2 家族 基因表达 数据库 泛素化 糖代谢 |
| title | 基于生物信息学途径评估 UBE2 家族及 UBE2T 基因在肺腺癌中的表达及临床意义 |
| title_full | 基于生物信息学途径评估 UBE2 家族及 UBE2T 基因在肺腺癌中的表达及临床意义 |
| title_fullStr | 基于生物信息学途径评估 UBE2 家族及 UBE2T 基因在肺腺癌中的表达及临床意义 |
| title_full_unstemmed | 基于生物信息学途径评估 UBE2 家族及 UBE2T 基因在肺腺癌中的表达及临床意义 |
| title_short | 基于生物信息学途径评估 UBE2 家族及 UBE2T 基因在肺腺癌中的表达及临床意义 |
| title_sort | 基于生物信息学途径评估 ube2 家族及 ube2t 基因在肺腺癌中的表达及临床意义 |
| topic | UBE2T UBE2 家族 基因表达 数据库 泛素化 糖代谢 |
| url | http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/43567561/ |
| work_keys_str_mv | AT yángháoshuài jīyúshēngwùxìnxīxuétújìngpínggūube2jiāzújíube2tjīyīnzàifèixiànáizhōngdebiǎodájílínchuángyìyì AT làihuìnà jīyúshēngwùxìnxīxuétújìngpínggūube2jiāzújíube2tjīyīnzàifèixiànáizhōngdebiǎodájílínchuángyìyì AT ráoyírú jīyúshēngwùxìnxīxuétújìngpínggūube2jiāzújíube2tjīyīnzàifèixiànáizhōngdebiǎodájílínchuángyìyì AT línxiǎopíng jīyúshēngwùxìnxīxuétújìngpínggūube2jiāzújíube2tjīyīnzàifèixiànáizhōngdebiǎodájílínchuángyìyì |