空肠弯曲杆菌诱导的结直肠癌的转录组学分析

空肠弯曲杆菌诱导的结直肠癌的转录组学分析

目的探究空肠弯曲杆菌（<italic>C. jejuni</italic>）的致癌机制。方法将18只雌性的C57BL/6<italic> Apc<sup>Min/+</sup></italic>小鼠随机分为<italic>C. jejuni</italic>感染组9只和空白对照组9只。采用灌胃<italic>C. jejuni</italic>和葡聚糖硫酸盐共同诱导<italic>Apc<sup>Min/+</sup></italic...

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Main Authors: 李燕, 毛玉丹, 张幸鼎, 牟相宇
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University 2022-07-01
Series:Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
Subjects:
空肠弯曲杆菌
结直肠癌
转录组
Online Access:http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/doi/10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2022.0405/
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author 李燕
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description 目的探究空肠弯曲杆菌（<italic>C. jejuni</italic>）的致癌机制。方法将18只雌性的C57BL/6<italic> Apc<sup>Min/+</sup></italic>小鼠随机分为<italic>C. jejuni</italic>感染组9只和空白对照组9只。采用灌胃<italic>C. jejuni</italic>和葡聚糖硫酸盐共同诱导<italic>Apc<sup>Min/+</sup></italic>小鼠产生结直肠癌。实验终点时，取各组小鼠结直肠组织解剖计数肿瘤个数，分别提取<italic>C. jejuni</italic>组4只小鼠和空白对照组3只小鼠的结直肠肿瘤和癌旁组织RNA，采用RNA-seq技术进行转录组学测序，筛选出差异表达基因后进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果与对照组相比，<italic>C. jejuni</italic>感染组肿瘤发生率显著增高（<italic>P</italic> &lt; 0.01），显示造模成功。RNA-seq测序结果显示，<italic>C. jejuni</italic>感染组的肿瘤组织跟两个对照组相比，分别有394个和501个差异表达基因（变化&gt;4倍；<italic>P</italic> &lt; 0.05）。GO富集分析差异基因主要富集在多种免疫反应的调控和激活途径、多种蛋白质转运和受体结合途径。KEGG通路富集分析癌症相关通路和代谢途径较显著。上述差异表达基因中，有17个基因在两次对照中均有出现，经过筛选，得到14个“核心”差异表达基因。在进一步的qRT-PCR验证中，有9个基因表达差异显著，其中有3个基因（<italic>Gm1987、Saxo1</italic>和<italic>Plekhs1</italic>）表达上调，6个基因（<italic>Lrp2、Serpina3c、Fabp4、Tmem52、Lrrn4</italic>和<italic>Upk3b</italic>）表达下调。结论本研究指出了9个可能在<italic>C. jejuni</italic>诱导的结直肠癌的发生发展中起到了重要且独特作用的宿主基因，为后续研究<italic>C. jejuni</italic>导致结直肠癌的机制提供了新的方向和思路。
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institution Kabale University
issn 1672-3554
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publishDate 2022-07-01
publisher Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University
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