DAS-ELISA and RT-PCR Methods for Detection of Potyviruses Infecting Shallot
Infeksi virus pada tanaman bawang merah di Indonesia merupakan salah satu faktor yang dapat menyebabkan penurunan produktivitas tanaman, terutama karena sifatnya yang terbawa umbi. Deteksi virus untuk memantau insidensi penyakit di lapangan atau memeriksa benih sehat membutuhkan metode yang akurat...
Saved in:
| Main Authors: | , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | Indonesian |
| Published: |
Perhimpunan Fitopatologi Indonesia
2025-05-01
|
| Series: | Jurnal Fitopatologi Indonesia |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://journal.ipb.ac.id/index.php/jfiti/article/view/35190 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| _version_ | 1850265757062004736 |
|---|---|
| author | Ivan Arif Rachman Martua Siregar Sri Hendrastuti Hidayat |
| author_facet | Ivan Arif Rachman Martua Siregar Sri Hendrastuti Hidayat |
| author_sort | Ivan Arif Rachman Martua Siregar |
| collection | DOAJ |
| description |
Infeksi virus pada tanaman bawang merah di Indonesia merupakan salah satu faktor yang dapat menyebabkan penurunan produktivitas tanaman, terutama karena sifatnya yang terbawa umbi. Deteksi virus untuk memantau insidensi penyakit di lapangan atau memeriksa benih sehat membutuhkan metode yang akurat dan dapat diandalkan. Pada penelitian ini dilakukan deteksi anggota Potyvirus, yaitu Onion yellow dwarf virus (OYDV) dan Shallot yellow stripe virus (SYSV) menggunakan metode double antibody sandwhich enzyme-linked immunosorbent assay (DAS-ELISA) dan reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) dari sampel daun bawang merah. Sampel daun dikumpulkan dari beberapa daerah penanaman bawang merah di Brebes dan Cirebon. Infeksi OYDV dan SYSV dideteksi menggunakan metode DAS-ELISA, selanjutnya sampel lapangan yang memberikan reaksi positif dipilih untuk deteksi lebih lanjut menggunakan metode RT-PCR dan perunutan asam nukleat dengan sikuensing. Berdasarkan metode DAS-ELISA, infeksi OYDV dan SYSV berhasil dideteksi dari sampel lapangan sebagai infeksi tunggal dan infeksi campuran. Infeksi Potyvirus terkonfirmasi dengan metode RT-PCR dari sampel lapangan yang memberikan reaksi positif dalam ELISA. Analisis sikuen nukleotida menunjukkan infeksi OYDV baik pada sampel yang bereaksi positif dengan antiserum OYDV maupun SYSV. Hasil tersebut mengindikasikan terjadinya reaksi silang antara antiserum OYDV dan SYSV.
|
| format | Article |
| id | doaj-art-f86fe71aaf5d4ffcb76df1d588aaa31a |
| institution | OA Journals |
| issn | 0215-7950 2339-2479 |
| language | Indonesian |
| publishDate | 2025-05-01 |
| publisher | Perhimpunan Fitopatologi Indonesia |
| record_format | Article |
| series | Jurnal Fitopatologi Indonesia |
| spelling | doaj-art-f86fe71aaf5d4ffcb76df1d588aaa31a2025-08-20T01:54:20ZindPerhimpunan Fitopatologi IndonesiaJurnal Fitopatologi Indonesia0215-79502339-24792025-05-0120510.14692/jfi.20.5.255-262DAS-ELISA and RT-PCR Methods for Detection of Potyviruses Infecting ShallotIvan Arif Rachman Martua Siregar0Sri Hendrastuti HidayatIPB University Infeksi virus pada tanaman bawang merah di Indonesia merupakan salah satu faktor yang dapat menyebabkan penurunan produktivitas tanaman, terutama karena sifatnya yang terbawa umbi. Deteksi virus untuk memantau insidensi penyakit di lapangan atau memeriksa benih sehat membutuhkan metode yang akurat dan dapat diandalkan. Pada penelitian ini dilakukan deteksi anggota Potyvirus, yaitu Onion yellow dwarf virus (OYDV) dan Shallot yellow stripe virus (SYSV) menggunakan metode double antibody sandwhich enzyme-linked immunosorbent assay (DAS-ELISA) dan reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) dari sampel daun bawang merah. Sampel daun dikumpulkan dari beberapa daerah penanaman bawang merah di Brebes dan Cirebon. Infeksi OYDV dan SYSV dideteksi menggunakan metode DAS-ELISA, selanjutnya sampel lapangan yang memberikan reaksi positif dipilih untuk deteksi lebih lanjut menggunakan metode RT-PCR dan perunutan asam nukleat dengan sikuensing. Berdasarkan metode DAS-ELISA, infeksi OYDV dan SYSV berhasil dideteksi dari sampel lapangan sebagai infeksi tunggal dan infeksi campuran. Infeksi Potyvirus terkonfirmasi dengan metode RT-PCR dari sampel lapangan yang memberikan reaksi positif dalam ELISA. Analisis sikuen nukleotida menunjukkan infeksi OYDV baik pada sampel yang bereaksi positif dengan antiserum OYDV maupun SYSV. Hasil tersebut mengindikasikan terjadinya reaksi silang antara antiserum OYDV dan SYSV. https://journal.ipb.ac.id/index.php/jfiti/article/view/35190analisis sikuenOnion yellow dwarf virusreaksi silangShallot yellow stripe virus |
| spellingShingle | Ivan Arif Rachman Martua Siregar Sri Hendrastuti Hidayat DAS-ELISA and RT-PCR Methods for Detection of Potyviruses Infecting Shallot Jurnal Fitopatologi Indonesia analisis sikuen Onion yellow dwarf virus reaksi silang Shallot yellow stripe virus |
| title | DAS-ELISA and RT-PCR Methods for Detection of Potyviruses Infecting Shallot |
| title_full | DAS-ELISA and RT-PCR Methods for Detection of Potyviruses Infecting Shallot |
| title_fullStr | DAS-ELISA and RT-PCR Methods for Detection of Potyviruses Infecting Shallot |
| title_full_unstemmed | DAS-ELISA and RT-PCR Methods for Detection of Potyviruses Infecting Shallot |
| title_short | DAS-ELISA and RT-PCR Methods for Detection of Potyviruses Infecting Shallot |
| title_sort | das elisa and rt pcr methods for detection of potyviruses infecting shallot |
| topic | analisis sikuen Onion yellow dwarf virus reaksi silang Shallot yellow stripe virus |
| url | https://journal.ipb.ac.id/index.php/jfiti/article/view/35190 |
| work_keys_str_mv | AT ivanarifrachmanmartuasiregar daselisaandrtpcrmethodsfordetectionofpotyvirusesinfectingshallot AT srihendrastutihidayat daselisaandrtpcrmethodsfordetectionofpotyvirusesinfectingshallot |