HIV-1辅助受体CCR5与其天然配体结合效果的综合评价
【目的】 探讨CCR5蛋白与天然配体的结合姿态位置,寻找CCR5的优化对接靶点及与天然配体结合的最优姿态,为HIV-1新型药物研发提供依据。【方法】 运用SWISS-MODEL构建天然配体的三维结构,运用Discovery studio软件ZDOCK模块模拟3种天然配体RANTES,MIP-1α和MIP-1β与CCR5对接,分析对接姿态,计算ZDOCK综合得分,评估结合效果优劣。【结果】 RANTES、MIP-1α和MIP-1β这3种天然配体主要是在N末端或第二个胞外环与CCR5蛋白结合。并且RANTES较MIP-1α和MIP-1β有更强的抑制作用。 【结论】 第二个胞外环可能是多肽抑制剂与C...
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Format: | Article |
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Language: | zho |
Published: |
Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University
2012-01-01
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Series: | Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban |
Subjects: | |
Online Access: | http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/43575689/ |
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institution | Kabale University |
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publishDate | 2012-01-01 |
publisher | Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University |
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series | Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban |
spelling | doaj-art-edb33c4eda514197b4693e478ada7dff2025-01-15T03:00:25ZzhoEditorial Office of Journal of Sun Yat-sen UniversityZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban1672-35542012-01-013343575689HIV-1辅助受体CCR5与其天然配体结合效果的综合评价【目的】 探讨CCR5蛋白与天然配体的结合姿态位置,寻找CCR5的优化对接靶点及与天然配体结合的最优姿态,为HIV-1新型药物研发提供依据。【方法】 运用SWISS-MODEL构建天然配体的三维结构,运用Discovery studio软件ZDOCK模块模拟3种天然配体RANTES,MIP-1α和MIP-1β与CCR5对接,分析对接姿态,计算ZDOCK综合得分,评估结合效果优劣。【结果】 RANTES、MIP-1α和MIP-1β这3种天然配体主要是在N末端或第二个胞外环与CCR5蛋白结合。并且RANTES较MIP-1α和MIP-1β有更强的抑制作用。 【结论】 第二个胞外环可能是多肽抑制剂与CCR5结合的主要位点。对于RANTES的分子修饰是未来研发多肽类CCR5抑制剂的首选方向。http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/43575689/Discovery StudioCCR5HIV-1天然配体 |
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