梅花鹿<italic>DLX5</italic>基因克隆及表达分析
为研究梅花鹿(<italic>Cervus nippon</italic>)<italic>DLX5</italic>基因的结构和功能,进一步探究其与梅花鹿茸角骨化机制间的关系,采用RT-PCR技术对梅花鹿<italic>DLX5</italic>基因进行克隆,获得包含全部编码区的cDNA序列,对该基因的氨基酸序列进行生物信息学分析并构建系统进化树,通过KEGG富集分析其信号通路,运用实时荧光定量RT-PCR检测该基因在鹿茸生长不同时期的表达情况。结果表明:梅花鹿<italic>DLX5</italic&...
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| Format: | Article |
| Language: | zho |
| Published: |
Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife
2024-02-01
|
| Series: | 野生动物学报 |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails#10.12375/ysdwxb.20240107 |
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|---|---|
| author | 王鹏 刘方政 李萱博 王春花 于海浩 夏彦玲 |
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| author_sort | 王鹏 |
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| description | 为研究梅花鹿(<italic>Cervus nippon</italic>)<italic>DLX5</italic>基因的结构和功能,进一步探究其与梅花鹿茸角骨化机制间的关系,采用RT-PCR技术对梅花鹿<italic>DLX5</italic>基因进行克隆,获得包含全部编码区的cDNA序列,对该基因的氨基酸序列进行生物信息学分析并构建系统进化树,通过KEGG富集分析其信号通路,运用实时荧光定量RT-PCR检测该基因在鹿茸生长不同时期的表达情况。结果表明:梅花鹿<italic>DLX5</italic>基因编码区长为870 bp,共编码289个氨基酸。DLX5蛋白为可溶性的不稳定蛋白,有2个保守结构域,主要定位于细胞核。梅花鹿DLX5蛋白与许多不同物种来源的DLX5蛋白氨基酸序列有较高相似度,比较保守。DLX5蛋白二级结构中无规则卷曲占比最大(78.89%),其后依次是<italic>α</italic>-螺旋、延伸链,占比分别为16.96%和4.15%。<italic>DLX5</italic>基因主要的作用通路为TGF<italic>β</italic>信号通路、MAPK信号通路和Wnt信号通路等。实时荧光定量RT-PCR结果表明,<italic>DLX5</italic>基因在鹿茸生长后期(三杈茸)表达量显著增高,这种上调表达暗示了其在鹿茸骨化过程中发挥重要作用,说明其可能是鹿茸骨化相关候选基因。 |
| format | Article |
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| institution | OA Journals |
| issn | 2310-1490 |
| language | zho |
| publishDate | 2024-02-01 |
| publisher | Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife |
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| series | 野生动物学报 |
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