白鹈鹕体内对盲囊线虫种类的鉴定及其ITS序列分析

白鹈鹕体内对盲囊线虫种类的鉴定及其ITS序列分析

为了鉴定从广东某地圈养的白鹈鹕体内的线虫种类,2个样本通过形态学观察初步鉴定为对盲囊线虫后,对虫体核糖体DNA(rDNA)内转录间隔区ITS-1、ITS-2及5.8S rDNA序列进行扩增和测序,并与GenBank<sup>TM</sup>公布的序列进行比对,构建系统发育树分析,确定其种类。结果显示,白鹈鹕体内线虫符合对盲囊线虫的形态学特征,其ITS-1序列长度为463 bp,与<i>Contracaecum</i> sp.(GenBank<sup>TM</sup>登录号:KF990496.1)ITS-1的序列相似性分别为...

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Main Author: 陈绚姣 宋美冉 单 芬 陈 武 李少基 彭仕明
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife 2014-01-01
Series:野生动物学报
Subjects:
鹈鹕
内转录间隔区
形态学观察
PCR扩增
序列分析
对盲囊线虫
Online Access:http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67074006&Fpath=home&index=0
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Description
Summary:为了鉴定从广东某地圈养的白鹈鹕体内的线虫种类,2个样本通过形态学观察初步鉴定为对盲囊线虫后,对虫体核糖体DNA(rDNA)内转录间隔区ITS-1、ITS-2及5.8S rDNA序列进行扩增和测序,并与GenBank<sup>TM</sup>公布的序列进行比对,构建系统发育树分析,确定其种类。结果显示,白鹈鹕体内线虫符合对盲囊线虫的形态学特征,其ITS-1序列长度为463 bp,与<i>Contracaecum</i> sp.(GenBank<sup>TM</sup>登录号:KF990496.1)ITS-1的序列相似性分别为98.9%、99.8%; ITS-2序列长度分别为288-289 bp,与<i>C.bancrofti</i>(GenBank<sup>TM</sup>登录号:FM177887.1)的ITS-2序列的相似性分别为96%、95%; 5.8SrDNA序列长度为157 bp。通过以ITS-1序列为分子标记的系统发育树分析,白鹈鹕体内线虫与<i>C.bancrofti</i>属同一分支,应为<i>C.bancrofti</i>。形态学鉴定方法结合ITS序列分析可以准确鉴定白鹈鹕体内线虫的种类,为其他线虫的快速准确鉴定提供参考。
ISSN:2310-1490

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