高原低氧环境抑制小鼠脾脏组织碳代谢的分子机制

目的探究低氧暴露对小鼠脾脏组织碳代谢通路的调控机制。方法将C57BL/6小鼠分别在海拔400 m和4 200 m饲养,每组5只,30 d后无菌取出脾脏组织,通过转录组测序,蛋白质组学和非靶向代谢组学分析差异表达基因、差异蛋白以及差异代谢物,利用GO和KEGG富集分析,挖掘关键通路,并通过RT-qPCR和Western blot对通路中关键基因和蛋白进行验证。结果转录组测序发现,低氧暴露下有4 213个基因出现显著性差异表达,其中1 947个基因表达上调,2 266个基因表达下调;差异表达蛋白分析发现166个蛋白表达上调,39个蛋白表达下调;非靶向代谢组学结果表明,高原低氧条件下存在133个差异...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Main Authors: 陈晓晨, 胡英, 许玉珍, 龙启福, 马茹雪, 永胜
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University 2024-09-01
Series:Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
Subjects:
Online Access:http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/doi/10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2024.0907.001/
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Description
Summary:目的探究低氧暴露对小鼠脾脏组织碳代谢通路的调控机制。方法将C57BL/6小鼠分别在海拔400 m和4 200 m饲养,每组5只,30 d后无菌取出脾脏组织,通过转录组测序,蛋白质组学和非靶向代谢组学分析差异表达基因、差异蛋白以及差异代谢物,利用GO和KEGG富集分析,挖掘关键通路,并通过RT-qPCR和Western blot对通路中关键基因和蛋白进行验证。结果转录组测序发现,低氧暴露下有4 213个基因出现显著性差异表达,其中1 947个基因表达上调,2 266个基因表达下调;差异表达蛋白分析发现166个蛋白表达上调,39个蛋白表达下调;非靶向代谢组学结果表明,高原低氧条件下存在133个差异代谢物,95个上调,38个下调;通过KEGG富集分析表明,差异表达基因、差异蛋白以及差异代谢物共同富集到碳代谢通路,因此,对碳代谢通路中的关键基因和蛋白进行验证,发现碳代谢通路中<italic>PGAM2</italic>、<italic>ENO3</italic>、<italic>PRPS2</italic>、<italic>PGLS</italic>、<italic>RPE</italic>、<italic>IDH3A</italic>、<italic>SUCLA2</italic>、<italic>MDH2</italic>的mRNA和蛋白表达量显著下调。结论高原低氧环境通过抑制机体碳代谢通路,减弱了糖酵解、三羧酸循环、磷酸戊糖途径,致使机体发生氧化应激、能量代谢失衡等。
ISSN:1672-3554