Аналіз різноманіття та генетичних взаємодій сортів картоплі (Solanum tuberosum L.) на основі морфологічних ознак та SSR-маркерів
Мета. Оцінити кореляційні зв’язки між SSR-маркерами та морфологічними ознаками за генетичними дистанціями на основі поліморфізму сортів картоплі. Методи. ПЛР-аналіз, кластерний та кореляційно-регресійний аналізи. Результати. Наведено результати аналізу поліморфізму сортів картоплі за молекулярно-г...
Saved in:
| Main Authors: | , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Ukrainian Institute for Plant Variety Examination
2018-10-01
|
| Series: | Plant Varieties Studying and Protection |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://journal.sops.gov.ua/article/view/145292 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| _version_ | 1849401027993796608 |
|---|---|
| author | Л. М. Присяжнюк О. Л. Кляченко І. О. Діхтяр Н. В. Симоненко |
| author_facet | Л. М. Присяжнюк О. Л. Кляченко І. О. Діхтяр Н. В. Симоненко |
| author_sort | Л. М. Присяжнюк |
| collection | DOAJ |
| description | Мета. Оцінити кореляційні зв’язки між SSR-маркерами та морфологічними ознаками за генетичними дистанціями на основі поліморфізму сортів картоплі.
Методи. ПЛР-аналіз, кластерний та кореляційно-регресійний аналізи.
Результати. Наведено результати аналізу поліморфізму сортів картоплі за молекулярно-генетичними та морфологічними маркерними ознаками. Поліморфізм сортів оцінювали за чотирма мікросателітними маркерами: STM0019, STM3009, STM3012, STM5136 та за 42 морфологічними маркерними ознаками. За результатами ПЛР-аналізу визначено, що частота ідентифікованих алелів становила від 0,021 до 0,33, індекс полімофності в середньому за досліджуваними маркерами – 0,76. За допомогою кластерного аналізу визначено генетичні дистанції між сортами за SSR- та морфологічними маркерами, виявлено подібні та сорти, які різнилися між собою. Відповідно до отриманого розподілу оцінено кореляційні зв’язки між генетичними дистанціями за Mantel test, а саме визначено регресію, в якій змінними є матриці подібності, що підсумовують попарні подібні значення між місцями вибірки. Унаслідок оцінювання генетичних дистанцій між дослідженими генотипами картоплі встановлено, що найподібнішими за маркерами STM0019, STM3009, STM3012, STM5136 виявилися сорти ‘Скарбниця’ та ‘Явір’, відстань між якими становила 2,45, тоді як найбільшу відстань – 3,74 виявлено між сортами ‘Левада’ та ‘Довіра’, ‘Фантазія’ та ‘Довіра’. За маркерними морфологічними ознаками найменше значення генетичних дистанцій – 8,9 спостерігалося для сортів ‘Слов’янка’ та ‘Поліське джерело’, найвіддаленішими виявилися ‘Околиця’ та ‘Довіра’, значення для яких становить 18,2. Встановлено, що сорт картоплі ‘Довіра’ зі значенням показників генетичних дистанцій 18,2 та 3,74 за морфологічними та SSR-маркерами відповідно виявився найвіддаленішим від інших досліджених генотипів. У результаті проведеного аналізу генетичних дистанцій за SSR-маркерами та морфологічними ознаками кореляційних зв’язків за Mantel test не виявлено.
Висновки. Застосування комплексу досліджень, які містять опис морфологічних ознак і мікросателітних маркерів є перспективним для ідентифікації сортів картоплі, створення колекцій загальновідомих сортів та визначення їх відмінностей. |
| format | Article |
| id | doaj-art-8a009adc3b6a4a1eb258842e834fb4e7 |
| institution | Kabale University |
| issn | 2518-1017 2518-7457 |
| language | English |
| publishDate | 2018-10-01 |
| publisher | Ukrainian Institute for Plant Variety Examination |
| record_format | Article |
| series | Plant Varieties Studying and Protection |
| spelling | doaj-art-8a009adc3b6a4a1eb258842e834fb4e72025-08-20T03:37:51ZengUkrainian Institute for Plant Variety ExaminationPlant Varieties Studying and Protection2518-10172518-74572018-10-0114327728410.21498/2518-1017.14.3.2018.145292145292Аналіз різноманіття та генетичних взаємодій сортів картоплі (Solanum tuberosum L.) на основі морфологічних ознак та SSR-маркерівЛ. М. Присяжнюк0О. Л. Кляченко1І. О. Діхтяр2Н. В. Симоненко3Ukrainian Institute for Plant Variety ExaminationNational University of Life and Environmental Sciences of UkraineUkrainian Institute for Plant Variety ExaminationUkrainian Institute for Plant Variety ExaminationМета. Оцінити кореляційні зв’язки між SSR-маркерами та морфологічними ознаками за генетичними дистанціями на основі поліморфізму сортів картоплі. Методи. ПЛР-аналіз, кластерний та кореляційно-регресійний аналізи. Результати. Наведено результати аналізу поліморфізму сортів картоплі за молекулярно-генетичними та морфологічними маркерними ознаками. Поліморфізм сортів оцінювали за чотирма мікросателітними маркерами: STM0019, STM3009, STM3012, STM5136 та за 42 морфологічними маркерними ознаками. За результатами ПЛР-аналізу визначено, що частота ідентифікованих алелів становила від 0,021 до 0,33, індекс полімофності в середньому за досліджуваними маркерами – 0,76. За допомогою кластерного аналізу визначено генетичні дистанції між сортами за SSR- та морфологічними маркерами, виявлено подібні та сорти, які різнилися між собою. Відповідно до отриманого розподілу оцінено кореляційні зв’язки між генетичними дистанціями за Mantel test, а саме визначено регресію, в якій змінними є матриці подібності, що підсумовують попарні подібні значення між місцями вибірки. Унаслідок оцінювання генетичних дистанцій між дослідженими генотипами картоплі встановлено, що найподібнішими за маркерами STM0019, STM3009, STM3012, STM5136 виявилися сорти ‘Скарбниця’ та ‘Явір’, відстань між якими становила 2,45, тоді як найбільшу відстань – 3,74 виявлено між сортами ‘Левада’ та ‘Довіра’, ‘Фантазія’ та ‘Довіра’. За маркерними морфологічними ознаками найменше значення генетичних дистанцій – 8,9 спостерігалося для сортів ‘Слов’янка’ та ‘Поліське джерело’, найвіддаленішими виявилися ‘Околиця’ та ‘Довіра’, значення для яких становить 18,2. Встановлено, що сорт картоплі ‘Довіра’ зі значенням показників генетичних дистанцій 18,2 та 3,74 за морфологічними та SSR-маркерами відповідно виявився найвіддаленішим від інших досліджених генотипів. У результаті проведеного аналізу генетичних дистанцій за SSR-маркерами та морфологічними ознаками кореляційних зв’язків за Mantel test не виявлено. Висновки. Застосування комплексу досліджень, які містять опис морфологічних ознак і мікросателітних маркерів є перспективним для ідентифікації сортів картоплі, створення колекцій загальновідомих сортів та визначення їх відмінностей.http://journal.sops.gov.ua/article/view/145292potatoesgenetic polymorphismcluster analysisMantel testcorrelation links |
| spellingShingle | Л. М. Присяжнюк О. Л. Кляченко І. О. Діхтяр Н. В. Симоненко Аналіз різноманіття та генетичних взаємодій сортів картоплі (Solanum tuberosum L.) на основі морфологічних ознак та SSR-маркерів Plant Varieties Studying and Protection potatoes genetic polymorphism cluster analysis Mantel test correlation links |
| title | Аналіз різноманіття та генетичних взаємодій сортів картоплі (Solanum tuberosum L.) на основі морфологічних ознак та SSR-маркерів |
| title_full | Аналіз різноманіття та генетичних взаємодій сортів картоплі (Solanum tuberosum L.) на основі морфологічних ознак та SSR-маркерів |
| title_fullStr | Аналіз різноманіття та генетичних взаємодій сортів картоплі (Solanum tuberosum L.) на основі морфологічних ознак та SSR-маркерів |
| title_full_unstemmed | Аналіз різноманіття та генетичних взаємодій сортів картоплі (Solanum tuberosum L.) на основі морфологічних ознак та SSR-маркерів |
| title_short | Аналіз різноманіття та генетичних взаємодій сортів картоплі (Solanum tuberosum L.) на основі морфологічних ознак та SSR-маркерів |
| title_sort | аналіз різноманіття та генетичних взаємодій сортів картоплі solanum tuberosum l на основі морфологічних ознак та ssr маркерів |
| topic | potatoes genetic polymorphism cluster analysis Mantel test correlation links |
| url | http://journal.sops.gov.ua/article/view/145292 |
| work_keys_str_mv | AT lmprisâžnûk analízríznomaníttâtagenetičnihvzaêmodíjsortívkartoplísolanumtuberosumlnaosnovímorfologíčnihoznaktassrmarkerív AT olklâčenko analízríznomaníttâtagenetičnihvzaêmodíjsortívkartoplísolanumtuberosumlnaosnovímorfologíčnihoznaktassrmarkerív AT íodíhtâr analízríznomaníttâtagenetičnihvzaêmodíjsortívkartoplísolanumtuberosumlnaosnovímorfologíčnihoznaktassrmarkerív AT nvsimonenko analízríznomaníttâtagenetičnihvzaêmodíjsortívkartoplísolanumtuberosumlnaosnovímorfologíčnihoznaktassrmarkerív |