长链非编码ＲＮＡ在舌鳞癌中的表达谱特征

长链非编码ＲＮＡ在舌鳞癌中的表达谱特征

摘 要： 【目的】 观察长链非编码ＲＮＡ（ｌｎｃＲＮＡ）在正常舌组织和舌鳞癌组织中表达谱的变化。 【方法】 利用ｌｎｃＲＮＡ表达谱芯片检测技术，筛查３例舌鳞癌组织及３例正常舌组织中ｌｎｃＲＮＡ表达谱的变异，通过对原始数据进行预处理达到均一化后，确定舌鳞癌组织中２倍以上变化并有显著差异（Ｐ＜０．０５ ） 的ｌｎｃＲＮＡ为差异表达ｌｎｃＲＮＡ，筛选出差异表达的ｌｎｃＲＮＡ；分别在ｓｃｃ－９、ｃａｌ－２７、ｕｍ－１和ｕｍ－２共４种人舌鳞癌细胞和１种人正常舌细胞以及在３５例舌鳞癌组织和１２例正常舌组织中，利用实时荧光定量逆转录－多聚酶链反应（ｑＲＴ－ＰＣＲ）对芯片结果进行验证；对筛选所得的部分差异表达...

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Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University 2014-01-01
Series:Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
Subjects:
长链非编码ＲＮＡ
舌鳞癌
ｌｎｃＲＮＡ芯片
Online Access:http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/43572993/
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description 摘 要： 【目的】 观察长链非编码ＲＮＡ（ｌｎｃＲＮＡ）在正常舌组织和舌鳞癌组织中表达谱的变化。 【方法】 利用ｌｎｃＲＮＡ表达谱芯片检测技术，筛查３例舌鳞癌组织及３例正常舌组织中ｌｎｃＲＮＡ表达谱的变异，通过对原始数据进行预处理达到均一化后，确定舌鳞癌组织中２倍以上变化并有显著差异（Ｐ＜０．０５ ） 的ｌｎｃＲＮＡ为差异表达ｌｎｃＲＮＡ，筛选出差异表达的ｌｎｃＲＮＡ；分别在ｓｃｃ－９、ｃａｌ－２７、ｕｍ－１和ｕｍ－２共４种人舌鳞癌细胞和１种人正常舌细胞以及在３５例舌鳞癌组织和１２例正常舌组织中，利用实时荧光定量逆转录－多聚酶链反应（ｑＲＴ－ＰＣＲ）对芯片结果进行验证；对筛选所得的部分差异表达的ｌｎｃＲＮＡ，利用ｌｎｃＲＮＡ与ｍＲＮＡ特异性表达的标准化信号强度，构建基因共表达网络，并进行分析。【结果】 芯片共筛选差异表达ｌｎｃＲＮＡ ３５９０条，其中上调的共１７８５条，降低的共 １８０５条；选取其中部分ｌｎｃＲＮＡ，ｑＲＴ－ＰＣＲ进一步证实了芯片结果的准确性；共表达网络构建提示某些ｌｎｃＲＮＡ可能在参与舌鳞癌发生发展过程中发挥重要调控作用。【结论】与正常舌组织比较，舌鳞癌组织ｌｎｃＲＮＡ表达谱发生显著变化，提示差异表达的ｌｎｃＲＮＡ 可能与舌鳞癌的多种恶性表型有着密切联系。
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institution Kabale University
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publisher Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University
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series Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
spelling doaj-art-7edc29cbd29f43c48386aa6589fc49b82025-01-15T02:58:01ZzhoEditorial Office of Journal of Sun Yat-sen UniversityZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban1672-35542014-01-013543572993长链非编码ＲＮＡ在舌鳞癌中的表达谱特征摘 要： 【目的】 观察长链非编码ＲＮＡ（ｌｎｃＲＮＡ）在正常舌组织和舌鳞癌组织中表达谱的变化。 【方法】 利用ｌｎｃＲＮＡ表达谱芯片检测技术，筛查３例舌鳞癌组织及３例正常舌组织中ｌｎｃＲＮＡ表达谱的变异，通过对原始数据进行预处理达到均一化后，确定舌鳞癌组织中２倍以上变化并有显著差异（Ｐ＜０．０５ ） 的ｌｎｃＲＮＡ为差异表达ｌｎｃＲＮＡ，筛选出差异表达的ｌｎｃＲＮＡ；分别在ｓｃｃ－９、ｃａｌ－２７、ｕｍ－１和ｕｍ－２共４种人舌鳞癌细胞和１种人正常舌细胞以及在３５例舌鳞癌组织和１２例正常舌组织中，利用实时荧光定量逆转录－多聚酶链反应（ｑＲＴ－ＰＣＲ）对芯片结果进行验证；对筛选所得的部分差异表达的ｌｎｃＲＮＡ，利用ｌｎｃＲＮＡ与ｍＲＮＡ特异性表达的标准化信号强度，构建基因共表达网络，并进行分析。【结果】 芯片共筛选差异表达ｌｎｃＲＮＡ ３５９０条，其中上调的共１７８５条，降低的共 １８０５条；选取其中部分ｌｎｃＲＮＡ，ｑＲＴ－ＰＣＲ进一步证实了芯片结果的准确性；共表达网络构建提示某些ｌｎｃＲＮＡ可能在参与舌鳞癌发生发展过程中发挥重要调控作用。【结论】与正常舌组织比较，舌鳞癌组织ｌｎｃＲＮＡ表达谱发生显著变化，提示差异表达的ｌｎｃＲＮＡ 可能与舌鳞癌的多种恶性表型有着密切联系。http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/43572993/长链非编码ＲＮＡ舌鳞癌ｌｎｃＲＮＡ芯片
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