构建MS2-RIP方法用于鉴定lncRNA DANCR在肿瘤细胞中的相互作用分子

构建MS2-RIP方法用于鉴定lncRNA DANCR在肿瘤细胞中的相互作用分子

目的为了探讨lncRNA DANCR在肿瘤细胞中的作用机制，本研究拟构建一种新的MS2-RIP方法用于鉴定DANCR的相互作用分子。方法利用MS2噬菌体衣壳蛋白可与噬菌体复制酶编码基因5’端一段由19个碱基组成的RNA茎环结构序列，即MS2结合位点（MS2 Binding Site，MS2 BS）高效结合的特点，构建串联表达MS2 BS和DANCR的过量表达质粒，通过MS2蛋白与MS2 BS的亲和作用，使DANCR得到富集，并且同步捕获与DANCR相互作用的分子，用于进一步分析鉴定。结果成功构建串联表达MS2 BS和DANCR的过量表达质粒用于MS2-RIP实验，该实验可显著富集DANCR以及...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Main Authors: 巫孟师, 熊敏敏, 彭丹, 韩雪, 钟小敏
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University 2021-01-01
Series:Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
Subjects:
MS2
RNA结合蛋白免疫沉淀
长链非编码RNA
DANCR
Online Access:http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/43496293/
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Description
Summary:目的为了探讨lncRNA DANCR在肿瘤细胞中的作用机制，本研究拟构建一种新的MS2-RIP方法用于鉴定DANCR的相互作用分子。方法利用MS2噬菌体衣壳蛋白可与噬菌体复制酶编码基因5’端一段由19个碱基组成的RNA茎环结构序列，即MS2结合位点（MS2 Binding Site，MS2 BS）高效结合的特点，构建串联表达MS2 BS和DANCR的过量表达质粒，通过MS2蛋白与MS2 BS的亲和作用，使DANCR得到富集，并且同步捕获与DANCR相互作用的分子，用于进一步分析鉴定。结果成功构建串联表达MS2 BS和DANCR的过量表达质粒用于MS2-RIP实验，该实验可显著富集DANCR以及作为阳性对照的DANCR结合蛋白EZH2。结论基于MS2蛋白与MS2结合位点的高效结合特性，我们针对lncRNA DANCR建立了MS2-RIP方法。该方法可有效富集DANCR以及与DANCR结合的生物活性分子，为研究DANCR的作用机制提供一种新的技术手段。
ISSN:1672-3554

Similar Items