Relaciones genéticas basadas en marcadores ISTR entre formas silvestres, cultivadas e intermedias de frijol de guía colectado en Jalisco, México
Antecedentes y Objetivos: En el frijol de guía (Phaseolus vulgaris) se distinguen tres formas principales: cultivada, intermedia y silvestre. El concepto de forma se utiliza como categoría jerárquica dentro de una especie de acuerdo a la divergencia morfológica y genética, distribución ecogeográfica...
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| Published: |
Instituto de Ecología A.C.
2017-01-01
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| Series: | Acta Botanica Mexicana |
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| Online Access: | https://abm.ojs.inecol.mx/index.php/abm/article/view/1200 |
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| author | Osvaldo A. Castellanos-Hernández Rogelio Lepiz-Ildefonso Guillermo Eduardo Castellanos-Enríquez Araceli Rodríguez-Sahagún Martha Isabel Torres-Morán |
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| description | Antecedentes y Objetivos: En el frijol de guía (Phaseolus vulgaris) se distinguen tres formas principales: cultivada, intermedia y silvestre. El concepto de forma se utiliza como categoría jerárquica dentro de una especie de acuerdo a la divergencia morfológica y genética, distribución ecogeográfica, posibilidades de hibridación y fertilidad de los híbridos y sus derivados. El objetivo fue detectar las relaciones genéticas entre poblaciones silvestres, intermedias y cultivadas provenientes de una región en el occidente de México.
Métodos: Se realizó un análisis en 30 poblaciones de frijol común de guía con datos moleculares obtenidos con el marcador ISTR (Inverse Sequence Tagged Repeat), basado en secuencias de retrotransposones copia-like. Se calculó la similitud por coeficiente de Jaccard entre cada planta analizada. Se determinó la estructura genética usando el modelo Bayesiano probabilístico.
Resultados clave: Se encontró un alto grado de diferenciación genética (FST) entre las formas cultivadas y las silvestres. Se infirió el número de grupos asociados a la hibridación entre los materiales, basados en el coeficiente de similitud. El análisis de estructura genética detectó nueve grupos dentro del material estudiado. El marcador ISTR se presenta como un marcador efectivo para diferenciar material cultivado del silvestre y establecer grados de similitud entre las accesiones.
Conclusiones: Se detectaron asociaciones entre las variedades cultivadas y accesiones intermedias, así como una clara separación de las cultivadas de las silvestres. Esta información genera datos valiosos para la caracterización de la variabilidad genética de este recurso, así como la obtención de datos importantes para el diseño de planes de conservación y mejoramiento.
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| institution | OA Journals |
| issn | 2448-7589 |
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| publisher | Instituto de Ecología A.C. |
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| series | Acta Botanica Mexicana |
| spelling | doaj-art-75c1e6f57c1349efbbe70caee9a4a8b62025-08-20T01:49:58ZengInstituto de Ecología A.C.Acta Botanica Mexicana2448-75892017-01-0111810.21829/abm118.2017.1200Relaciones genéticas basadas en marcadores ISTR entre formas silvestres, cultivadas e intermedias de frijol de guía colectado en Jalisco, MéxicoOsvaldo A. Castellanos-Hernández0Rogelio Lepiz-Ildefonso1Guillermo Eduardo Castellanos-Enríquez2Araceli Rodríguez-Sahagún3Martha Isabel Torres-Morán4Universidad de Guadalajara, Centro Universitario de la CiénegaUniversidad de Guadalajara, Centro Universitario de Ciencias Biológicas y AgropecuariasUniversidad de Guadalajara, Centro Universitario de Ciencias Biológicas y AgropecuariasUniversidad de Guadalajara, Centro Universitario de la CiénegaUniversidad de Guadalajara, Centro Universitario de Ciencias Biológicas y AgropecuariasAntecedentes y Objetivos: En el frijol de guía (Phaseolus vulgaris) se distinguen tres formas principales: cultivada, intermedia y silvestre. El concepto de forma se utiliza como categoría jerárquica dentro de una especie de acuerdo a la divergencia morfológica y genética, distribución ecogeográfica, posibilidades de hibridación y fertilidad de los híbridos y sus derivados. El objetivo fue detectar las relaciones genéticas entre poblaciones silvestres, intermedias y cultivadas provenientes de una región en el occidente de México. Métodos: Se realizó un análisis en 30 poblaciones de frijol común de guía con datos moleculares obtenidos con el marcador ISTR (Inverse Sequence Tagged Repeat), basado en secuencias de retrotransposones copia-like. Se calculó la similitud por coeficiente de Jaccard entre cada planta analizada. Se determinó la estructura genética usando el modelo Bayesiano probabilístico. Resultados clave: Se encontró un alto grado de diferenciación genética (FST) entre las formas cultivadas y las silvestres. Se infirió el número de grupos asociados a la hibridación entre los materiales, basados en el coeficiente de similitud. El análisis de estructura genética detectó nueve grupos dentro del material estudiado. El marcador ISTR se presenta como un marcador efectivo para diferenciar material cultivado del silvestre y establecer grados de similitud entre las accesiones. Conclusiones: Se detectaron asociaciones entre las variedades cultivadas y accesiones intermedias, así como una clara separación de las cultivadas de las silvestres. Esta información genera datos valiosos para la caracterización de la variabilidad genética de este recurso, así como la obtención de datos importantes para el diseño de planes de conservación y mejoramiento. https://abm.ojs.inecol.mx/index.php/abm/article/view/1200conservaciónfrijol de guíamejoramientoretrotransposonesvariabilidad genética |
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