Análisis genético de cinco polimorfismos de nucleótido simple de caseínas lácteas obtenidos con chips genómicos en ganado Holstein de Antioquia, Colombia
Los polimorfismos genéticos asociados con las caseínas de la leche son de gran importancia, ya que pueden ser usados como marcadores genéticos para mejorar el rendimiento productivo en los hatos lecheros. El objetivo de este estudio fue evaluar la diversidad y estructura genética de 5 SNP de caseína...
Saved in:
| Main Authors: | , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | Spanish |
| Published: |
Universidad Nacional de Colombia
2021-01-01
|
| Series: | Revista de la Facultad de Medicina Veterinaria y de Zootecnia |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://www.redalyc.org/articulo.oa?id=407670223005 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| _version_ | 1825200410804092928 |
|---|---|
| author | J. Padilla-Doval J. C. Zambrano-Arteaga J. J. Echeverri-Zuluaga A. López-Herrera |
| author_facet | J. Padilla-Doval J. C. Zambrano-Arteaga J. J. Echeverri-Zuluaga A. López-Herrera |
| author_sort | J. Padilla-Doval |
| collection | DOAJ |
| description | Los polimorfismos genéticos asociados con las caseínas de la leche son de gran importancia, ya que pueden ser usados como marcadores genéticos para mejorar el rendimiento productivo en los hatos lecheros. El objetivo de este estudio fue evaluar la diversidad y estructura genética de 5 SNP de caseínas de la leche, obtenidos con chips genómicos en vacas y toros de raza Holstein en Antioquia (Colombia). Fueron muestreados 113 animales de raza Holstein en 3 regiones del departamento de Antioquia (norte, centro y oriente) y un cuarto grupo de sementales comerciales. Los animales fueron genotipificados con chips genómicos de alta densidad (Illumina BovineHD e Illumina SNP50 v2), a partir de los cuales se identificaron 5 SNP (ARS-BFGL-NGS-8140, BTA-77380-no-rs, BTA-32346-no-rs, BTB-00821654 y ARS-BFGL-NGS-15809). Para cada SNP se realizó un análisis genético mediante un análisis de varianza molecular (amova) usando el software GenAIEx 6.501. Los SNP con mayor heterocigosidad total (HT) fueron ARS-BFGL-NGS-8140 y BTA-32346-no-rs, con resultados cercanos al 45%; sin embargo, la Ht para ARS-BFGL-NGS-15809, BTA-77380-no-rs y BTB-00821654 estuvo por debajo del 15%. El SNP con mayor diversidad genética fue BTA-32346-no-rs (Ho-He = 0,06; p < 0,05). En esta investigación se evaluó una subpoblación de toros comerciales extranjeros, en la cual se obtuvieron frecuencias alélicas y genotípicas similares a las obtenidas para las subpoblaciones locales, sugiriendo que los alelos de los toros muy posiblemente están fijados en dichas subpoblaciones, por lo que la estructura y diversidad genética tienden a ser bajas en la muestra de estudio. |
| format | Article |
| id | doaj-art-66f2a358fffa4d56a7560e2cb774fd3b |
| institution | Kabale University |
| issn | 0120-2952 2357-3813 |
| language | Spanish |
| publishDate | 2021-01-01 |
| publisher | Universidad Nacional de Colombia |
| record_format | Article |
| series | Revista de la Facultad de Medicina Veterinaria y de Zootecnia |
| spelling | doaj-art-66f2a358fffa4d56a7560e2cb774fd3b2025-02-07T19:46:44ZspaUniversidad Nacional de ColombiaRevista de la Facultad de Medicina Veterinaria y de Zootecnia0120-29522357-38132021-01-0168213714910.15446/rfmvz.v68n2.98026Análisis genético de cinco polimorfismos de nucleótido simple de caseínas lácteas obtenidos con chips genómicos en ganado Holstein de Antioquia, ColombiaJ. Padilla-DovalJ. C. Zambrano-ArteagaJ. J. Echeverri-ZuluagaA. López-HerreraLos polimorfismos genéticos asociados con las caseínas de la leche son de gran importancia, ya que pueden ser usados como marcadores genéticos para mejorar el rendimiento productivo en los hatos lecheros. El objetivo de este estudio fue evaluar la diversidad y estructura genética de 5 SNP de caseínas de la leche, obtenidos con chips genómicos en vacas y toros de raza Holstein en Antioquia (Colombia). Fueron muestreados 113 animales de raza Holstein en 3 regiones del departamento de Antioquia (norte, centro y oriente) y un cuarto grupo de sementales comerciales. Los animales fueron genotipificados con chips genómicos de alta densidad (Illumina BovineHD e Illumina SNP50 v2), a partir de los cuales se identificaron 5 SNP (ARS-BFGL-NGS-8140, BTA-77380-no-rs, BTA-32346-no-rs, BTB-00821654 y ARS-BFGL-NGS-15809). Para cada SNP se realizó un análisis genético mediante un análisis de varianza molecular (amova) usando el software GenAIEx 6.501. Los SNP con mayor heterocigosidad total (HT) fueron ARS-BFGL-NGS-8140 y BTA-32346-no-rs, con resultados cercanos al 45%; sin embargo, la Ht para ARS-BFGL-NGS-15809, BTA-77380-no-rs y BTB-00821654 estuvo por debajo del 15%. El SNP con mayor diversidad genética fue BTA-32346-no-rs (Ho-He = 0,06; p < 0,05). En esta investigación se evaluó una subpoblación de toros comerciales extranjeros, en la cual se obtuvieron frecuencias alélicas y genotípicas similares a las obtenidas para las subpoblaciones locales, sugiriendo que los alelos de los toros muy posiblemente están fijados en dichas subpoblaciones, por lo que la estructura y diversidad genética tienden a ser bajas en la muestra de estudio.http://www.redalyc.org/articulo.oa?id=407670223005betacaseínakappacaseínaproducción de lechemarcador genético |
| spellingShingle | J. Padilla-Doval J. C. Zambrano-Arteaga J. J. Echeverri-Zuluaga A. López-Herrera Análisis genético de cinco polimorfismos de nucleótido simple de caseínas lácteas obtenidos con chips genómicos en ganado Holstein de Antioquia, Colombia Revista de la Facultad de Medicina Veterinaria y de Zootecnia beta caseína kappa caseína producción de leche marcador genético |
| title | Análisis genético de cinco polimorfismos de nucleótido simple de caseínas lácteas obtenidos con chips genómicos en ganado Holstein de Antioquia, Colombia |
| title_full | Análisis genético de cinco polimorfismos de nucleótido simple de caseínas lácteas obtenidos con chips genómicos en ganado Holstein de Antioquia, Colombia |
| title_fullStr | Análisis genético de cinco polimorfismos de nucleótido simple de caseínas lácteas obtenidos con chips genómicos en ganado Holstein de Antioquia, Colombia |
| title_full_unstemmed | Análisis genético de cinco polimorfismos de nucleótido simple de caseínas lácteas obtenidos con chips genómicos en ganado Holstein de Antioquia, Colombia |
| title_short | Análisis genético de cinco polimorfismos de nucleótido simple de caseínas lácteas obtenidos con chips genómicos en ganado Holstein de Antioquia, Colombia |
| title_sort | analisis genetico de cinco polimorfismos de nucleotido simple de caseinas lacteas obtenidos con chips genomicos en ganado holstein de antioquia colombia |
| topic | beta caseína kappa caseína producción de leche marcador genético |
| url | http://www.redalyc.org/articulo.oa?id=407670223005 |
| work_keys_str_mv | AT jpadilladoval analisisgeneticodecincopolimorfismosdenucleotidosimpledecaseinaslacteasobtenidosconchipsgenomicosenganadoholsteindeantioquiacolombia AT jczambranoarteaga analisisgeneticodecincopolimorfismosdenucleotidosimpledecaseinaslacteasobtenidosconchipsgenomicosenganadoholsteindeantioquiacolombia AT jjecheverrizuluaga analisisgeneticodecincopolimorfismosdenucleotidosimpledecaseinaslacteasobtenidosconchipsgenomicosenganadoholsteindeantioquiacolombia AT alopezherrera analisisgeneticodecincopolimorfismosdenucleotidosimpledecaseinaslacteasobtenidosconchipsgenomicosenganadoholsteindeantioquiacolombia |