基于高原鼠兔简化基因组数据的微卫星引物开发

基于高原鼠兔简化基因组数据的微卫星引物开发

高原鼠兔（Ochotona curzoniae）是青藏高原的关键种，对其分子标记的开发有助于高原鼠兔种群生态等问题的研究。基于简化基因组测序技术获得了高原鼠兔简化基因组序列信息，并开发了微卫星分子标记。结果表明：通过MISA软件分析共检测到7 064个SSR位点，其中单核苷酸和二核苷酸重复基序数量最多，各占4615%和3837%。四核苷酸重复基序的类型最多，达83种；其次是三核苷酸重复基序的类型，为50种。不同类型SSR位点基序的重复次数也不同。通过取SSR与InDel的交集，获得182处符合条件的SSR区域，并最终设计出90对引物。随机选择70对引物在8个高原鼠兔样本中进行验证，有42对...

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Main Author: 贺玉姣 1 胡万军 2 都玉蓉 1 王婷 1 杜雷 1 胡书立 1
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife 2021-01-01
Series:野生动物学报
Subjects:
高原鼠兔
简化基因组测序
微卫星引物
Online Access:http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67056610&Fpath=home&index=0
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