不同区域晶状体上皮细胞基因表达差异分析
【目的】比较不同区域猪晶状体上皮细胞的基因表达在转录组水平上的差异。【方法】解剖显微镜下分离晶状体前囊膜, 将附着于其上的上皮细胞分为中央( 直径为 10.56 mm) 和周边两部分。分别提取两个样本的总 RNAs 并经 PCR 扩增, 以 Cy3 和 Cy5 分别标记扩增的中央与周边部分的 cDNA, 与含 7548 个基因的表达谱芯片杂交, 经图像分析, 生物信息学处理获得基因表达在转录水平差异的相关信息。【结果】中央与周边区域的猪晶状体上皮细胞在转录组水平共鉴定出952个有效表达的基因点, 其中差异表达基因 261 个, 以中央区域为参照, 周边上皮细胞 mRNA 上调 137 个, 下...
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| Main Authors: | , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | zho |
| Published: |
Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University
2006-01-01
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| Series: | Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban |
| Online Access: | http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/43582428/ |
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| Summary: | 【目的】比较不同区域猪晶状体上皮细胞的基因表达在转录组水平上的差异。【方法】解剖显微镜下分离晶状体前囊膜, 将附着于其上的上皮细胞分为中央( 直径为 10.56 mm) 和周边两部分。分别提取两个样本的总 RNAs 并经 PCR 扩增, 以 Cy3 和 Cy5 分别标记扩增的中央与周边部分的 cDNA, 与含 7548 个基因的表达谱芯片杂交, 经图像分析, 生物信息学处理获得基因表达在转录水平差异的相关信息。【结果】中央与周边区域的猪晶状体上皮细胞在转录组水平共鉴定出952个有效表达的基因点, 其中差异表达基因 261 个, 以中央区域为参照, 周边上皮细胞 mRNA 上调 137 个, 下调 124 个。差异表达基因主要涉及的功能有: 细胞周期与凋亡、细胞骨架蛋白及细胞外基质、转录、细胞信号分子等。【结论】中央与周边区域猪晶状体上皮细胞基因表达在转录组水平上差异明显。这类差异呈明显的功能聚类。 |
|---|---|
| ISSN: | 1672-3554 |