无蹼壁虎线粒体全基因组及系统发育分析

无蹼壁虎线粒体全基因组及系统发育分析

经PCR扩增和序列测定,获得了无蹼壁虎(<i>Gekko swinhonis</i>)的线粒体基因组全序列,其总长为16 818 bp,含有13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个控制区。各基因的位置、排列顺序及转录方向均和大部分的有鳞目物种一致。无蹼壁虎线粒体基因组的碱基组成分别为:A(31.35%)、T(26.28%)、C(27.71%)、G(14.67%)。除Ser(GCU)缺失DHU臂外,其余的21个tRNA都可以形成典型三叶草结构。13个蛋白质编码基因中,除ND2基因以ATA为起始密码子外,其余12个基因均使用ATG为起始密码子。无蹼壁...

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Main Author: 秦 峰 曾德龙 高成伟 秦新民
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife 2017-01-01
Series:野生动物学报
Subjects:
无墣壁虎
线粒体基因组
系统发育
Online Access:http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67063976&Fpath=home&index=0
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Description
Summary:经PCR扩增和序列测定,获得了无蹼壁虎(<i>Gekko swinhonis</i>)的线粒体基因组全序列,其总长为16 818 bp,含有13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个控制区。各基因的位置、排列顺序及转录方向均和大部分的有鳞目物种一致。无蹼壁虎线粒体基因组的碱基组成分别为:A(31.35%)、T(26.28%)、C(27.71%)、G(14.67%)。除Ser(GCU)缺失DHU臂外,其余的21个tRNA都可以形成典型三叶草结构。13个蛋白质编码基因中,除ND2基因以ATA为起始密码子外,其余12个基因均使用ATG为起始密码子。无蹼壁虎5个基因(ND1、ATP8、ATP6、ND4L、ND4)以TAA为终止密码子,ND6和Cyt<i>b</i>基因以TAG为终止密码子,CO1以AGA为终止密码,其余5个基因为不完全终止密码TA-或T-(ND2、CO2、ND5和CO3为T-,ND3为TA-)。控制区位于tRNA<sup>Pro</sup>和 tRNA<sup>Phe</sup>之间,全长1 456 bp,含有一些终止相关序列和保守序列(TAS,CBS1-3)。基于13个蛋白质编码基因氨基酸序列构建的BI系统发育树分析表明,无蹼壁虎与壁虎科的<i>Tarentola mauritanica</i>的亲缘关系最近。
ISSN:2310-1490

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