Semejanzas entre el ajo (Allium sativum) costarricense y el ajo asiático según secuencias de ADN ribosomal
En Costa Rica, la producción de ajo (Allium sativum) es escasa y se limita principalmente a las regiones de Llano Grande de Cartago. Sin embargo, por el precio que tiene actualmente en el mercado, el ajo costarricense se vislumbra como una hortaliza que podría constituirse en un recurso valioso para...
Saved in:
| Main Authors: | , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Instituto Tecnológico de Costa Rica
2012-08-01
|
| Series: | Tecnología en Marcha |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://www.tec-digital.itcr.ac.cr/servicios/ojs/index.php/tec_marcha/article/view/312 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| _version_ | 1850256285423894528 |
|---|---|
| author | Karina Barboza Rojas Alejandro Hernández Soto Claudia Zúñiga Vega |
| author_facet | Karina Barboza Rojas Alejandro Hernández Soto Claudia Zúñiga Vega |
| author_sort | Karina Barboza Rojas |
| collection | DOAJ |
| description | En Costa Rica, la producción de ajo (Allium sativum) es escasa y se limita principalmente a las regiones de Llano Grande de Cartago. Sin embargo, por el precio que tiene actualmente en el mercado, el ajo costarricense se vislumbra como una hortaliza que podría constituirse en un recurso valioso para los productores nacionales. Por lo anterior, en este artículo se presenta la caracterización mediante secuencias ribosomales de materiales de ajo provenientes Costa Rica y su comparación con ajo importado de China. El ADN se extrajo a partir de hojas de vitroplantas de ajo mantenidas en un congelador a -70°C, pulverizadas en un mortero. El ADN ribosomal se amplificó, purificó y secuenció. Se realizó el análisis bioinformático de las secuencias ribosomales. El BLASTn permitió determinar que los productos de PCR amplificados corresponden a la secuencia parcial de los genes 28S y 18S (sitios de unión de los cebadores) y a la secuencia completa de la región ITS-1, 5.8S e ITS-2. Se encontró que todas las secuencias alinearon en casi un 100% con la accesión EU626375.1 publicada en la base de datos del GeneBank, correspondiente al clon Allium sativum voucher BF-ALL-037. En general, las secuencias mostraron ser muy conservadas. Los puntajes obtenidos del alineamiento realizado con ClustalW reflejaron una identidad del 97 al 99% entre las secuencias.El presente estudio es el primer reporte de este tipo que se realiza sobre ajo costarricense y generó información básica e indispensable para continuar con los estudios moleculares de este cultivo. |
| format | Article |
| id | doaj-art-45e4ffefae7241a880ffb17d9c63b2b8 |
| institution | OA Journals |
| issn | 0379-3982 2215-3241 |
| language | English |
| publishDate | 2012-08-01 |
| publisher | Instituto Tecnológico de Costa Rica |
| record_format | Article |
| series | Tecnología en Marcha |
| spelling | doaj-art-45e4ffefae7241a880ffb17d9c63b2b82025-08-20T01:56:41ZengInstituto Tecnológico de Costa RicaTecnología en Marcha0379-39822215-32412012-08-01252Semejanzas entre el ajo (Allium sativum) costarricense y el ajo asiático según secuencias de ADN ribosomalKarina Barboza RojasAlejandro Hernández SotoClaudia Zúñiga VegaEn Costa Rica, la producción de ajo (Allium sativum) es escasa y se limita principalmente a las regiones de Llano Grande de Cartago. Sin embargo, por el precio que tiene actualmente en el mercado, el ajo costarricense se vislumbra como una hortaliza que podría constituirse en un recurso valioso para los productores nacionales. Por lo anterior, en este artículo se presenta la caracterización mediante secuencias ribosomales de materiales de ajo provenientes Costa Rica y su comparación con ajo importado de China. El ADN se extrajo a partir de hojas de vitroplantas de ajo mantenidas en un congelador a -70°C, pulverizadas en un mortero. El ADN ribosomal se amplificó, purificó y secuenció. Se realizó el análisis bioinformático de las secuencias ribosomales. El BLASTn permitió determinar que los productos de PCR amplificados corresponden a la secuencia parcial de los genes 28S y 18S (sitios de unión de los cebadores) y a la secuencia completa de la región ITS-1, 5.8S e ITS-2. Se encontró que todas las secuencias alinearon en casi un 100% con la accesión EU626375.1 publicada en la base de datos del GeneBank, correspondiente al clon Allium sativum voucher BF-ALL-037. En general, las secuencias mostraron ser muy conservadas. Los puntajes obtenidos del alineamiento realizado con ClustalW reflejaron una identidad del 97 al 99% entre las secuencias.El presente estudio es el primer reporte de este tipo que se realiza sobre ajo costarricense y generó información básica e indispensable para continuar con los estudios moleculares de este cultivo.http://www.tec-digital.itcr.ac.cr/servicios/ojs/index.php/tec_marcha/article/view/312Allium sativumajo costarricenseADNrnregiones ITS |
| spellingShingle | Karina Barboza Rojas Alejandro Hernández Soto Claudia Zúñiga Vega Semejanzas entre el ajo (Allium sativum) costarricense y el ajo asiático según secuencias de ADN ribosomal Tecnología en Marcha Allium sativum ajo costarricense ADNrn regiones ITS |
| title | Semejanzas entre el ajo (Allium sativum) costarricense y el ajo asiático según secuencias de ADN ribosomal |
| title_full | Semejanzas entre el ajo (Allium sativum) costarricense y el ajo asiático según secuencias de ADN ribosomal |
| title_fullStr | Semejanzas entre el ajo (Allium sativum) costarricense y el ajo asiático según secuencias de ADN ribosomal |
| title_full_unstemmed | Semejanzas entre el ajo (Allium sativum) costarricense y el ajo asiático según secuencias de ADN ribosomal |
| title_short | Semejanzas entre el ajo (Allium sativum) costarricense y el ajo asiático según secuencias de ADN ribosomal |
| title_sort | semejanzas entre el ajo allium sativum costarricense y el ajo asiatico segun secuencias de adn ribosomal |
| topic | Allium sativum ajo costarricense ADNrn regiones ITS |
| url | http://www.tec-digital.itcr.ac.cr/servicios/ojs/index.php/tec_marcha/article/view/312 |
| work_keys_str_mv | AT karinabarbozarojas semejanzasentreelajoalliumsativumcostarricenseyelajoasiaticosegunsecuenciasdeadnribosomal AT alejandrohernandezsoto semejanzasentreelajoalliumsativumcostarricenseyelajoasiaticosegunsecuenciasdeadnribosomal AT claudiazunigavega semejanzasentreelajoalliumsativumcostarricenseyelajoasiaticosegunsecuenciasdeadnribosomal |