马鹿<italic>CDK8</italic>基因生物信息学分析与组织表达

为探究细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶8基因(<italic>CDK8</italic>)在马鹿(<italic>Cervus elaphus</italic>)鹿茸的皮、间充质、前软骨和软骨组织中的mRNA表达水平和该基因编码蛋白的生物学特性,采用PCR方法克隆马鹿<italic>CDK8</italic>基因编码区(CDS)全长序列,并连入pMD-18T载体,测得核苷酸序列,进行相似性比对和系统进化树构建;利用生物信息学方法分析CDK8蛋白的组成、结构和理化性质;利用实时荧光定量PCR技术检测<italic>CD...

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Main Authors: 唐成怡, 吴玄烨, 吴尽, 杨帆, 刘学东
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife 2023-08-01
Series:野生动物学报
Subjects:
Online Access:http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails#10.12375/ysdwxb.20230312
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Description
Summary:为探究细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶8基因(<italic>CDK8</italic>)在马鹿(<italic>Cervus elaphus</italic>)鹿茸的皮、间充质、前软骨和软骨组织中的mRNA表达水平和该基因编码蛋白的生物学特性,采用PCR方法克隆马鹿<italic>CDK8</italic>基因编码区(CDS)全长序列,并连入pMD-18T载体,测得核苷酸序列,进行相似性比对和系统进化树构建;利用生物信息学方法分析CDK8蛋白的组成、结构和理化性质;利用实时荧光定量PCR技术检测<italic>CDK8</italic>基因mRNA在鹿茸组织中的表达水平。结果表明:马鹿<italic>CDK8</italic>的CDS全长1 254 bp,共编码417个氨基酸;所编码的蛋白相对分子质量为47 744.11,理论等电点(pI)为7.28,是一种无信号肽、定位于细胞核的亲水性不稳定蛋白,共38个磷酸化位点,蛋白的二级结构以无规则蜷曲和<italic>α</italic>螺旋为主。<italic>CDK8</italic>的mRNA在茸皮组织中表达量最高,其后依次是间充质、软骨和前软骨。CDK8是转录机器中介体复合物的重要组成部分,研究克隆获得马鹿<italic>CDK8</italic>的CDS全长序列,可为了解鹿茸再生过程中<italic>CDK8</italic>的作用机制与功能提供重要的基础数据。
ISSN:2310-1490