乳腺癌生存期相关长非编码 MAPT-AS1 及其共表达基因筛选与验证
【目的】筛选乳腺癌患者生存期相关差异表达长链非编码RNA（lncRNA）及其共表达基因，并验证其乳腺癌细胞中的表达情况。【方法】通过TCGA数据库筛选943例RNA-seq数据信息：（837例乳腺癌患者+106例正常对照），发现长非编码MAPT-AS1高表达，乳腺癌患者生存期更长。构建长非编码MAPT-AS1过表达和干扰质粒，将构建好的质粒转染乳腺癌细胞株T47D，并用嘌呤霉素筛选出稳定表达的T47D细胞株，通过RT-qPCR验证长非编码MAPT-AS1及其共表达基因的表达情况。【结果】荧光显微镜观察及RT-qPCR验证，成功构建长非编码MAPT-AS1过表达及干扰稳定转染乳腺癌细胞株T47D...
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| Format: | Article |
| Language: | zho |
| Published: |
Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University
2019-01-01
|
| Series: | Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/43546614/ |
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| author | 许家瑞 刘冬冬 李贝贝 陈梦麟 黄凯铃 郑周霞 徐建华 |
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| description | 【目的】筛选乳腺癌患者生存期相关差异表达长链非编码RNA（lncRNA）及其共表达基因，并验证其乳腺癌细胞中的表达情况。【方法】通过TCGA数据库筛选943例RNA-seq数据信息：（837例乳腺癌患者+106例正常对照），发现长非编码MAPT-AS1高表达，乳腺癌患者生存期更长。构建长非编码MAPT-AS1过表达和干扰质粒，将构建好的质粒转染乳腺癌细胞株T47D，并用嘌呤霉素筛选出稳定表达的T47D细胞株，通过RT-qPCR验证长非编码MAPT-AS1及其共表达基因的表达情况。【结果】荧光显微镜观察及RT-qPCR验证，成功构建长非编码MAPT-AS1过表达及干扰稳定转染乳腺癌细胞株T47D，并筛选出干扰效率最高的长非编码MAPT-AS1干扰片段shRNA3。验证其共表达基因得到MAPT、MAPT-IT1和NXNL2在转染了干扰片段shRNA3后表达量降低，与长非编码MAPT-AS1的表达趋势一致。【结论】成功构建长非编码MAPT-AS1过表达及干扰稳定转染乳腺癌细胞株T47D，验证其和共表达基因表达情况与数据库一致，为进一步研究长非编码MAPT-AS1基因在乳腺癌中的作用机制奠定基础。 |
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| institution | Kabale University |
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| language | zho |
| publishDate | 2019-01-01 |
| publisher | Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University |
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| series | Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban |
| spelling | doaj-art-04b0ac2401d646c68b530d70ed58c81c2025-01-15T02:34:36ZzhoEditorial Office of Journal of Sun Yat-sen UniversityZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban1672-35542019-01-014043546614乳腺癌生存期相关长非编码 MAPT-AS1 及其共表达基因筛选与验证许家瑞刘冬冬李贝贝陈梦麟黄凯铃郑周霞徐建华【目的】筛选乳腺癌患者生存期相关差异表达长链非编码RNA（lncRNA）及其共表达基因，并验证其乳腺癌细胞中的表达情况。【方法】通过TCGA数据库筛选943例RNA-seq数据信息：（837例乳腺癌患者+106例正常对照），发现长非编码MAPT-AS1高表达，乳腺癌患者生存期更长。构建长非编码MAPT-AS1过表达和干扰质粒，将构建好的质粒转染乳腺癌细胞株T47D，并用嘌呤霉素筛选出稳定表达的T47D细胞株，通过RT-qPCR验证长非编码MAPT-AS1及其共表达基因的表达情况。【结果】荧光显微镜观察及RT-qPCR验证，成功构建长非编码MAPT-AS1过表达及干扰稳定转染乳腺癌细胞株T47D，并筛选出干扰效率最高的长非编码MAPT-AS1干扰片段shRNA3。验证其共表达基因得到MAPT、MAPT-IT1和NXNL2在转染了干扰片段shRNA3后表达量降低，与长非编码MAPT-AS1的表达趋势一致。【结论】成功构建长非编码MAPT-AS1过表达及干扰稳定转染乳腺癌细胞株T47D，验证其和共表达基因表达情况与数据库一致，为进一步研究长非编码MAPT-AS1基因在乳腺癌中的作用机制奠定基础。http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/43546614/乳腺癌长链非编码RNA共表达基因 |
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