核孔蛋白93在神经母细胞瘤患者中的表达及临床意义
目的基于基因表达数据库(GEO)筛选神经母细胞瘤(NB)诊断和预后相关的关键基因,探讨关键基因核孔蛋白93(<italic>NUP93</italic>)在NB患者组织中的表达及临床意义。方法从GEO数据库中获取NB基因芯片数据(GSE73517、GSE49710、GSE19274),筛选高风险组共同上调的差异表达基因(DEGs),结合R2基因组分析和可视化平台进一步分析在<italic>MYCN</italic>扩增组中共同上调的DEGs的预后价值,筛选出关键基因;最后通过免疫组织化学法(IHC)检测60例NB、25例神经节神经母细胞瘤(GNB...
Saved in:
| Main Authors: | , , , , , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | zho |
| Published: |
Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University
2025-05-01
|
| Series: | Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/thesisDetails#10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2025.0307 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Summary: | 目的基于基因表达数据库(GEO)筛选神经母细胞瘤(NB)诊断和预后相关的关键基因,探讨关键基因核孔蛋白93(<italic>NUP93</italic>)在NB患者组织中的表达及临床意义。方法从GEO数据库中获取NB基因芯片数据(GSE73517、GSE49710、GSE19274),筛选高风险组共同上调的差异表达基因(DEGs),结合R2基因组分析和可视化平台进一步分析在<italic>MYCN</italic>扩增组中共同上调的DEGs的预后价值,筛选出关键基因;最后通过免疫组织化学法(IHC)检测60例NB、25例神经节神经母细胞瘤(GNB)和26例神经节神经瘤(GN)组织中NUP93的表达水平。结果①筛选出25个高风险组共同上调的DEGs,其中10个在<italic>MYCN</italic>扩增组中高表达(<italic>P</italic><0.05),分别为<italic>SIVA1</italic>、<italic>NUP93</italic>、<italic>STIP1</italic>、<italic>LSM4</italic>、<italic>RAI14</italic>、<italic>MYOZ3</italic>、<italic>KNTC1</italic>、<italic>TNFRSF10B</italic>、<italic>TACC3</italic>、<italic>CEP152</italic>;生存分析显示,<italic>NUP93</italic>高表达患者总生存期显著缩短(HR=4.0,95%CI:3.0,5.3,<italic>P</italic>=1.80×10⁻³⁴)。②免疫组化结果显示,NUP93在NB组织中的表达水平高于GN和GNB(<italic>P</italic><0.001),且与高有丝分裂-核碎裂指数(MKI)(<italic>P</italic>=0.040)、低分化程度(<italic>P</italic><0.001)及MYCN表达(<italic>r<sub>s </sub></italic>=0.793,<italic>P</italic><0.001)呈正相关。结论经筛选获得的关键基因<italic>NUP93</italic>的高表达与高MKI及分化程度低相关,并预示NB患儿的不良预后,可能通过调控<italic>MYCN</italic>促进肿瘤进展,有望成为NB诊断标志物及治疗靶点。 |
|---|---|
| ISSN: | 1672-3554 |